单台单级式实验室离心机由于结构较简单，液体的通道也较宽，在处理含有固体杂质的物料时，其适应性要比单台多级实验室离心机好。但是当物料中固体杂质含量多时，运行过程中会在转筒澄清段的内壁积累，使设备的操作性能逐渐变差，其积累到一定厚度时，会把转筒堰段的部分液体通道堵塞，这时只能中断运行拆洗设备。至于单台多级实验室离心机，由于结构比较复杂和部分液体通道较窄，所以更易被固体杂质堵塞，且设备的拆装和清洗也更麻烦。因此物料在进入萃取系统之前先除去固体杂质是必要的。
往实验室离心机添加的物料中不要含有在萃取过程中能引起严重乳化的杂质，否则应进行必要的预处理将其清除。实验室离心机依靠离心力使混合液分相，有一定的破乳能力。但是一般实验室离心机的离心分离因数ɑ的数值只是在几百到几千之间，因而破乳能力有限。若发生比较严重的乳化，一般实验室离心机是不能正常运行的。
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